Het Defensie Helikopter Commando omhelst momenteel 12 verschillende squadrons, verdeeld over de vliegbases Gilze-Rijen, Leeuwarden, Maritiem Vliegkamp De Kooy en de Amerikaanse legerbasis Fort Hood, Texas. Deze zijn onderverdeeld in vijf operationele squadrons, twee squadrons voor opleiding en expertise, drie squadrons voor materieel en logistiek en, last but not least, twee basis squadrons voor faciliteit en ondersteuning.
Het 303 SAR Squadron zal in de nabije toekomst worden opgeheven en de SAR-taak verhuist naar 860 Squadron zodra de NH-90 daarvoor beschikbaar is. Het is nog steeds de bedoeling de acht transport NH-90’s onder te brengen bij 300 Squadron, waar de resterende Alouette III helikopters op termijn zullen worden uitgefaseerd.
| unit | thuisbasis | helikopter | hoofdtaak |
| 7 Sqn | De Kooy | – | opleiding / expertise (maritiem) |
| 298 Sqn | Gilze-Rijen | Chinook | middelzwaar transport |
| 299 Sqn | Gilze-Rijen | – | opleiding / expertise (land) |
| 300 Sqn | Gilze-Rijen | Cougar, Alouette III | utility & VIP transport |
| 301 Sqn | Gilze-Rijen | Apache | grondsteun |
| 302 Sqn | Ft Hood, USA | Apache, Chinook | opleiding |
| 303 Sqn | Leeuwarden | AB-412 | SAR |
| 860 Sqn | De Kooy | NH90 | SAR / maritieme (scheeps) operaties |
| 930 Sqn | Gilze-Rijen | – | onderhoud |
| 931 Sqn | Gilze-Rijen | – | faciliteit & ondersteuning |
| 932 Sqn | Gilze-Rijen | – | logistiek |
| 990 Sqn | De Kooy | – | onderhoud en logistiek |
| 991 Sqn | De Kooy | – | faciliteit & ondersteuning |
